Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2e2Q9D902 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e2Q9D902 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms