Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Q9D8Q6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Q9D8Q6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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