Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms