Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc3Q9D6Y1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc3Q9D6Y1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc3Q9D6Y1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc3Q9D6Y1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc3Q9D6Y1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc3Q9D6Y1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc3Q9D6Y1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms