Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tube1Q9D6T1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms