Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms