Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D5Q8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms