Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc6Q9D4E6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc6Q9D4E6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc6Q9D4E6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc6Q9D4E6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc6Q9D4E6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc6Q9D4E6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc6Q9D4E6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms