Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms