Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms