Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc8Q9D2H8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Fndc8Q9D2H8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Fndc8Q9D2H8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc8Q9D2H8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms