Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bcas2Q9D287 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms