Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms