Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms