Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl11Q9CXW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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