Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms