Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms