Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms