Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930535I16RikQ9CUI2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms