Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms