Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms