Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms