Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms