Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms