Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQC3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms