Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms