Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921530L21RikQ9CQ47 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921530L21RikQ9CQ47 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms