Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims1Q99NE5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms