Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprtQ99M80 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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