Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins4Q99LZ3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms