Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd3Q99LY2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdpd3Q99LY2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms