Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnpo2Q99LG2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnpo2Q99LG2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms