Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99KU6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q99KU6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q99KU6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99KU6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99KU6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms