Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms