Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clint1Q99KN9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms