Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms