Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG5

Lsr, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsrQ99KG5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LsrQ99KG5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LsrQ99KG5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms