Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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