Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Afg3l1Q920A7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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