Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Pde6cQ91ZQ1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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Pde6cQ91ZQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Pde6cQ91ZQ1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Pde6cQ91ZQ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Pde6cQ91ZQ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Pde6cQ91ZQ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Pde6cQ91ZQ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Pde6cQ91ZQ1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde6cQ91ZQ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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