Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1bQ91YK2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1bQ91YK2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms