Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q91WD4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q91WD4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q91WD4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q91WD4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q91WD4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms