Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csde1Q91W50 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms