Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce2Q91VT1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce2Q91VT1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce2Q91VT1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce2Q91VT1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce2Q91VT1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce2Q91VT1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce2Q91VT1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce2Q91VT1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce2Q91VT1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce2Q91VT1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms