Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenomQ8VHC3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms