Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgbl1Q8VDV0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgbl1Q8VDV0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgbl1Q8VDV0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgbl1Q8VDV0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgbl1Q8VDV0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgbl1Q8VDV0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgbl1Q8VDV0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgbl1Q8VDV0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgbl1Q8VDV0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms