Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClmpQ8R373 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClmpQ8R373 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms