Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hecw1Q8K4P8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw1Q8K4P8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms