Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot6Q8K3P5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms