Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms